ダンジョン
第１章
魔法の森「７F」 ボス：―
魔法の森・魔理沙邸付近、比較的安全
魔理沙に頼まれキノコ集め
簡単なダンジョンでチュートリアル（説明付き）
クリア後はさらに奥へと進めるようになり、珍しいキノコを集められる
集めたキノコの数・種類・珍しさに応じて魔理沙にアイテムを貰える
・・・ん？ガラクタなんかじゃないぜ！
迷いの竹林「１５F」 ボス：因幡てゐ
憎き外道ウサギ（俺かよｗｗ）を退治しよう
敵はウサギが多め
比較的簡単なダンジョン
ボスはてゐ、まさに外道！
霧の湖「２０F」 中ボス：三月精 ボス：チルノ
お馬鹿な妖精共を蹴散せ！
中ボスに妖精多数
ここを抜ければ、いよいよ紅魔館だ！
あたいはバカじゃない〜！
紅魔館「３０F」 中ボス：パチェリー・ノーレッジ ボス：フランドール・スカーレット
第1章ラストダンジョン
門番中国の所まで村から直行可能
メイド軍団多数
妹様撃破で遂にエンディング
クリア後は５０Fまで進めるようになり、最深部では真・フランドールが待ち受ける！
妹様？ボッコボコにしてやんよ！
第二章
迷いの竹林・肝試し「２０F」 ボス：ー
案内役の妹紅と共に永遠亭を目指せ！
流石は肝試し、夜の敵は一味違う！
今回は心強い味方が・・・てか、もっこす強えｗｗｗｗｗｗｗ
途中でてゐの死骸を拾ったり
正直者じゃなくても死ぬんだな
・・・って死んだふりかよ、騙したな！？
永遠亭「２０F」 ボス：蓬莱山輝夜（イベント）
永遠亭を占拠したヤゴコロ軍団多数・・・ヤゴコロ自重しろｗｗｗｗｗ
最深部では輝夜が相変わらずネトゲ廃人と化していた
右手でネトゲをやり続け、左手で２ｃｈにレスし、ポテチを取り、食べるっ！！
この事態でもPCの前から離れようとしないダメ人間・・・てるよの根性を叩きなおせ！
永遠亭裏口「２５F」 ボス：八意永琳（イベント）
永遠亭を占拠したヤゴコロ軍団多数・・・ヤゴコロ自爆しろｗｗｗｗｗ
最深部にはヤゴコロに操られた永琳が！
えーりん！えーりん！えーりんを助けろ！！
冥界「２５F」 ボス：妖夢
白玉楼へと続く死者の世界
とてつもなく幽霊が多い
文の写真機で心霊写真撮り放題
幽霊には通常攻撃は通じない、スペルを駆使して立ち向かえ！
満月にやられた妖夢が襲ってくる、目がー！目がー！！
永遠亭「３５F」 ボス：ヤゴコロ
本編最終ダンジョン
月の軍勢ヤゴコロの本拠地と化した永遠亭
右も左もヤゴコロだらけｗｗｗｗｗｗｗ
永琳を助け出し、月の軍勢を幻想郷から追い払え！
いよいよ最終決戦、ヤゴコロを自重させろ！！！！！！！！！
Exダンジョン
再考の道「５０F」
魔法の森を通り抜けた場所に存在する、無縁塚へと続く道
今までとは比べ物にならないくらい強力な敵が容赦なく襲ってくる！
最強装備と万全の体制で挑もう！
あまりの難易度に、頭の中がフジヤマヴォルケイノ！！
妖怪の山「９９F」
さまざまな妖怪が住まう山
アリスの釘で妖怪たちを人形に変えてしまえ！
そして人形を駆使し深部へと進み、妖怪の人形を集めまくれ！
なお、集めた人形はアリス邸にてコレクション可
ごっすん！ごっすん！五寸釘！！
妖怪の山・内部「９９F」
妖怪達によって作られた巨大な文明都市
難易度は極高だが、そのぶんアイテムが非常に豊富
現地調達で装備を整えつつ、妖怪のお宝をゲットしよう！
借りるだけだ、私が死ぬまで！
白玉楼「５０F」
幽霊だらけの大きな屋敷
限られた装備の中、頼れるのはスペルカード
スペルを上手く使いこなし、妖怪桜までたどり着け！
このスペルで倒せぬものなど、あんまり無い！
中有の道「９９F」
一切のアイテムを持ち込めない死後の道
三途の川を抜けて彼岸へと続く
腕だけではなく運をも味方につけなければならない
裁判長のありがたいお説教を聞きにいけ・・・きゃん！
結界の狭間「５０F」 中ボス：橙・八雲藍 ボス：八雲紫
博麗神社にある結界のすきま
入り口が狭いすきまのため、装備品ぐらいしか持ち込めない
少女臭が！少女臭が！ゆかりんのもとまでたどり着け！
月の都
輝夜達の生まれ故郷であると共に、ヤゴコロ達の本拠地
幻想郷の常識を凌駕する月面都市
実はヤゴコロっていい奴だったり・・・するのかなぁ
神をも超えた究極ダンジョンの数々
５つの難題をクリアできるか！？(･)｡(･)